苗木的成活率除了挖取時要保證足夠的土球尺寸，在運輸過程中也有很多需要注意的地方，這個環節如果出問題，會大大影響苗木日后的生長和成活率。
運輸過程中應注意以下幾點：一、苗木裝車量要計算準確。根據苗木高度樹冠以及土球大小等因素，綜合計算出單車的裝載數量。超載會造成苗木擠壓嚴重，影響苗木質量，也不利于運輸安全；二、苗木在裝卸車時應輕吊輕放，由熟練的裝卸工來操作，不得損傷苗木樹枝、樹皮和土球的完整。吊機的大小應該和所吊運的苗木重量和大小相匹配。對于大型苗木，必須用中型吊機操作。如果一味圖便宜而用小吊機，會嚴重影響苗木的質量；三、苗木裝好后，不管是裸根的還是帶土球包裝的，都需要司機用油布覆蓋，以保證長途運輸中苗木最小限度地失水。裝車時應順序碼放整齊；裝車后應將樹干捆牢，并應加墊層防止磨損樹干；四、花灌木運輸時可直立裝車；竹類運輸時，不得損傷竹竿與竹鞭之間的著生點和鞭芽；五、裸根苗木盡可能到地頭后當天種植。裸樹苗木自起苗開始暴露時間不宜過長，當天不能種植下去的苗木應進行假植，并澆水保濕。帶土球小型花灌木運至施工現場后，應緊密排碼整齊，當日不能種植應，應噴水保持土球濕潤。